• Quinta Película de la serie.
• Concluye la saga de Johto con esta película.
• Se presentan dos Pokémon Legendarios y uno normal pertenecientes a la Tercera Generación.
  

Pokémon Heroes, la quinta película de esta saga Pokémon se remonta en una misteriosa ciudad, en el agua, en donde Ash, Pikachu, Misty y Brock llegan.

La película introduce dos nuevos y valientes Pokémon, Latios y Latias, que poseen potentes habilidades psíquicas y el poder de salvar a toda la Humanidad.

El problema comienza cuando 2 miembros Especiales del Equipo Rocket, enviados por Giovanni, tratan de apoderarse de una Roca muy poderosa, que mantiene el equilibrio de las aguas de la ciudad y que tiene una fuerte conexión con los guardianes legendarios Latias y Latios.

El equipo Rocket logrará tener el control y nuestros héroes harán lo imposible para poder mantener el equilibrio, pero para ello, tendrán que pagar un gran precio...

• Los Legendarios utilizar una técnica llamada Visión Compartida, dicha habilidad no existe en los videojuegos.
• Annie y Oakley leen sobre Lawrence III (villano de Pokémon 2000) en los créditos de la película.
• Al final de la película Ash Ketchum recibe un beso, lo que se desconoce es quién se lo da, si es Latias o Bianca.
• En la edición americana se cortan los dos primeros minutos de la película donde se explicaba el origen de la Joya Alma.

• A los personajes principales se les invita a comer mariscos, se supone que en el mundo Pokémon no existen crustáceos o animales comunes.
• En la presentación de la película, Ash Ketchum se ve en el Laboratorio con su ropa de viaje, cuando en realidad él va en ropa de dormir a buscar su Pokémon.
• En la presentación, se ve que Pikachu inmediatamente se vuelve amigo de Ash, en realidad fue todo un proceso para hacerse amigos.